Penyelengaraan Program Studi Pendidikan Fisika diawali dengan dibukanya Universitas Nahdalatul Ulama Cirebon pada tanggal 16 September 2011 berdasarkan Surat Keputusan Nomor 200/E/0/2011 tentang izin pendirian Universitas Nahdlatul Ulama di Cirebon Provinsi Jawa Barat yang diselenggarakan oleh Yayasan Cahaya Putera Bangsa di Kota Cirebon sesuai dengan Keputusan Menteri Pendidikan Nasional.
Program Studi Pendidikan Fisika FKIP UNU Cirebon terus melakukan peningkatan mutu dan relevansi produk-produk akademiknya, pegembangan staf modernisasi prasarana dan sarana pendidikan, termasuk infrastruktur teknologi informasi (ICT), meningkatkan efektifitas dan efisiensi manajemen, pengembangan suasana akademik dan kepedulian pada kualitas dalam komunitas kampus.